Саундтрек для Episode One написал Келли Бейли, являющийся автором музыки почти всех игр вселенной Half-Life. В саундтрек входит десять оригинальных композиций. В папке с игрой названия файлов этих композиций имеют формат «VLVX_song[номер трека]». Ниже приведены их оригинальные названия: Трек 6, «Eine Kleiner Elevatormuzik», является римейком вступления музыкальной пьесы Моцарта «Eine Kleine Nachtmusik», которая числится в списках музыки компании Muzak.
Помимо новых композиций, в игре используется Трек 18 из Half-Life 1 (но он также присутствует и во второй части) и треки 5, 28, 34 (ремикс на Трек 24 из первой части), 47 и 50 из Half-Life 2.
Саундтрек первого эпизода изначально можно было извлечь лишь из папки с игрой, официально на дисках он не распространялся. Позже, однако, в российское издание набора The Orange Box был включён музыкальный CD, в который вошла вся музыка из Episode One вместе с саундтреком Episode Two. 21 декабря 2007 года Valve выпустила собственный The Orange Box Original Soundtrack, содержащий подборку музыкальных треков из игр The Orange Box.Из Episode One туда вошли треки 1, 2 и 3.